Maverick Viñales (Movistar Yamaha MotoGP) aconsegueix la pole position del Gran Premi de San Marino, seguit d’Andrea Dovisiozo (Ducati Team) en segon lloc i Marc Márquez (Repsol Honda Team) en tercer.
Amb tots els favorits que es van qualificar directament per a la Q2, la Q1 va ser una batalla interessant pel que fa a qui seria el millor dels altres. Álvaro Bautista (Pull & Bear Aspar Team) i Jack Miller (Estrella Galicia 0.0 Marc VDS) tenien el millor temps en la primera tanda, ocupant els primers llocs. Seguit de Jonas Folger (Monster Yamaha Tech 3) i Tito Rabat (Estrella Galicia 0.0 Marc VDS), qui sembla haver trobat una nova vida a la seva moto Marc VDS. Sam Lowes (Aprilia Racing Team Gresini) va caure i va perdre tota opció de qualificar-se en la graella sortida, el britànic sortirà últim.
A la segona tanda es va veure a Pol Espargaró (Red Bull KTM Factory Racing) caure una altra vegada de la seva KTM, mentre que Jonas Folger millorava el seu crono, agafant el primer lloc. Miller també va millorar superant a Bautista per 0.015s. Quan direcció de carrera va decidir cancel·lar les voltes ràpides de Miller i Folger. La decisió va promoure els companys d’equip Álvaro Bautista i Karl Abraham (Pull & Bear Aspar Team) a entrar automàticament a la Q2.
A la Q2, Marc Márquez (Repsol Honda Team) semblava l’home a batre sobre paper. Encara que Andrea Dovisiozo (Ducati Team) va demostrar que podia ser ràpid en els lliures, totes les mirades es van fixar en els 2 pilots. En el primer stint, vam veure una volta molt sorprenent de Maverick Viñales (Movistar Yamaha MotoGP) que superava a Márquez. Jorge Lorenzo (Ducati Team) i Dani Pedrosa (Repsol Honda Team) també semblaven estar a la batalla amb un tercer i quart lloc, seguit d’Andrea Dovisiozo en cinquè lloc.
A la segona tanda, Andrea Dovisiozo va ser el primer a millorar el seu temps i va poder vèncer a Marc Márquez amb un avantatge de només 0.020s. Márquez, també semblava estar millorant, però va caure. El català no va ser capaç de millorar el seu temps. L’únic que encara seguia en pista i era capaç de lluitar per la pole position era Maverick Viñales de Yamaha. El català va aconseguir una enorme volta i es va endur la pole position, amb Andrea Dovisiozo en segona posició i Marc Márquez, tot i que va caure, en tercer lloc.
Cal Crutchlow (LCR Honda), Johann Zarco (Monster Yamaha Tech 3) i Jorge Lorenzo sortiran des de la segona fila. Dani Pedrosa, Danilo Petrucci (OCTO Pramac Racing) i Aleix Espargaró (Aprilia Racing Team Gresini) sortiran des de la 3 fila.