Márquez trenca la maledicció i guanya a Motegi després de proclamar-se campió, una victòria que, a més, li atorga a Honda el títol de constructors. Quartararo ha sigut segon i Dovizioso tercer.
Va arrencar la cursa i Marc Márquez es va mantenir al capdavant. Fabio Quartararo es va posar segon amb Jack Miller tercer i Cal Crutchlow quart. Franco Morbidelli va caure del segon al cinquè lloc, però va poder superar de nou a Crutchlow i a Miller. Quartararo va arribar a liderar breument, però va tornar ràpidament a la segona posició.
Miller i Morbidelli van estar diverses voltes intercanviant-se les posicions, el que va propiciar que Andrea Dovizioso, cinquè, arribés a la seva posició. L’australià va acabar deixant enrere l’italià, que veia la seva quarta plaça amenaçada per Dovizioso i per Maverick Viñales. Per darrere, Andrea Iannone va caure.
Miller va perdre ritme i va caure fins a la sisena plaça, de manera que Morbidelli va tornar a l’última plaça de podi, però el va superar Dovizioso. Àlex Rins va avançar a Miller per posar-se sisè. L’australià seguia perdent, i Crutchlow li va treure la setena posició.
Morbidelli es va anar llarg i li va cedir la quarta plaça a Viñales. L’espanyol, juntament amb Dovizioso, va deixar enrere a Morbidelli. Crutchlow va superar Rins per la sisena plaça i, al mateix temps, Joan Mir va superar Miller per la vuitena.
Valentino Rossi, que lluitava per la desena plaça amb Danilo Petrucci, va caure a 4 voltes del final. Petrucci, per la seva banda, va passar a Miller i es va posar novè. Crutchlow es va posar cinquè en superar a Morbidelli.
Res va canviar d’aquí al final i Marc Márquez va aconseguir la seva 80a victòria al mundial en una cursa en la que gairebé no ha tingut rival. Quartararo ha pogut ser segon i s’assegura el títol de rookie de l’any malgrat l’estirada final d’un Andrea Dovizioso que completa el podi. Viñales, Morbidelli, Crutchlow, Rins, Mir, Petrucci i Miller completen el Top 10. Aquests resultats li donen a Honda seu 25è títol de constructors.