Sebastian Vettel a gagné la deuxième course de la saison avec une grande polémique avec son coéquipier. Les deux pilotes de Red Bull ont suivi des stratégies différentes, mais Webber est sorti par devant de Vettel après son dernier pitstop. La différence était si petite qu’ils ont lutté pour la victoire pendant plusieurs tours, apparemment sans l’influence de son équipe, mais il y avait une tension évidente aux communications de radio et au podium. Après eux, les Mercedes ont suivi des ordres pour finir Hamilton le 3ème et Rosberg le 4ème sans risquer de perdre les points. L’allemand a dit à son équipe que : « Il faudra se rappeler de ça ».
La course a fini bientôt pour Fernando Alonso, quand il perdait le nez de sa voiture après avoir heurté contre Sebastian Vettel au deuxième virage. La piste était mouillé, et la stratégie de l’équipe Ferrari était rester en piste jusqu’à on pourrait utiliser les pneus de pluie. Ça n’a pas été possible, car l’aileron a fini par se casser. La course a continué et l’action aux boxes a commencé très tôt, quand Vettel, qui était en tête, a décidé de risquer à mettre les pneus slicks. Tous les autres l’ont imité quand ils ont vu qu’il allait bien.
On a pu voir beaucoup de problèmes aux boxes ; Pic et Vergne ont heurté, les deux Force India ont dû se retirer parce qu’ils ne pouvaient pas changer les pneus et Jenson Button a perdu sa course quand on lui a mal mis la rue avant droite. En plus, Lewis Hamilton a essayé de faire son pitstop au box de McLaren.
Grosjean, Raikkonen, Hulkenberg et Pérez ont lutté pour les autres points entre eux, mais Felipe Massa a été celui qui a fini le 5ème. Il les a tous avancés après changer les pneumatiques presque à la fin. Jean-Éric Vergne a fini le 10ème et comme ça il a gagné le premier point de la saison pour Toro Rosso. Il faut faire remarquer la course de Jules Bianchi, qui a fini le 13ème avec son Marussia, plus de 30s. par devant de Pic et au même tour que Esteban Gutierrez.
Résultat du Grand Prix de Malaisie :
| P | Pilote | Équipe | Différence | Pit Stops |
| 1 | Sebastian Vettel | Red Bull Racing-Renault | 1:38:56.681 | 4 |
| 2 | Mark Webber | Red Bull Racing-Renault | +4.2 | 4 |
| 3 | Lewis Hamilton | Mercedes | +12.1 | 4 |
| 4 | Nico Rosberg | Mercedes | +12.6 | 4 |
| 5 | Felipe Massa | Ferrari | +25.6 | 4 |
| 6 | Romain Grosjean | Lotus-Renault | +35.5 | 3 |
| 7 | Kimi Räikkönen | Lotus-Renault | +48.4 | 3 |
| 8 | Nico Hulkenberg | Sauber-Ferrari | +53.0 | 4 |
| 9 | Sergio Pérez | McLaren-Mercedes | +72.3 | 4 |
| 10 | Jean-Eric Vergne | STR-Ferrari | +87.1 | 3 |
| 11 | Valtteri Bottas | Williams-Renault | +88.6 | 3 |
| 12 | Esteban Gutiérrez | Sauber-Ferrari | +1 V | 4 |
| 13 | Jules Bianchi | Marussia-Cosworth | +1 V | 4 |
| 14 | Charles Pic | Caterham-Renault | +1 V | 4 |
| 15 | Giedo van der Garde | Caterham-Renault | +1 V | 4 |
| 16 | Max Chilton | Marussia-Cosworth | +2 V | 4 |
| 17 | Jenson Button | McLaren-Mercedes | +3 V | 3 |
| 18 | Daniel Ricciardo | STR-Ferrari | +5 V | 3 |
| 19 | Pastor Maldonado | Williams-Renault | +11 V | OUT |
| 20 | Adrian Sutil | Force India-Mercedes | +29 V | OUT |
| 21 | Paul di Resta | Force India-Mercedes | +34 V | OUT |
| 22 | Fernando Alonso | Ferrari | +55 V | OUT |