C’est la 3e année consécutive où Nico Rosberg remporte la pole du Grand Prix du Japon. Son coéquipier chez Mercedes Lewis Hamilton a été 2e par devant Kimi Räikkönen.
Les Ferrari ont été les plus rapides en Q1 avec les pneus tendres, alors que les Mercedes étaient juste après eux avec les medium. Red Bull a aussi utilisé les medium. Button, Magnussen, Ericsson, Nasr, Ocon et Wehrlein ont été les pilotes éliminés.
Rosberg a été 4 dixièmes plus rapide que Hamilton en Q2. Les Ferraris ont été 3e et 4e devant les Red Bull. Haas a surpris tout le monde comme le 4e équipe, spécialement les Williams, qui sont restés en Q3. Les pilotes éliminés ont été Bottas, Massa, Kvyat, Sainz, Alonso et Palmer.
Après être dépassé très légèrement par Rosberg tout le week-end, Hamilton a été 2 dixièmes plus rapide que Rosberg dans leur première tentative. Les Ferrari et Red Bull étaient séparés seulement par 1 dixième. Finalement, Rosberg a été le plus rapide 0.015 par devant Hamilton. Räikkönen a été le 3e par devant son coéquipier, mais Vettel fera son départ depuis la 7e position à cause de son pénalité du GP de la Malaisie. Verstappen et Ricciardo ont été 5e et 6e. Derrière eux, Pérez, Grosjean, Hülkenberg et Gutiérrez ont complété le top 10.