Thomas Luthi ha dominado la carrera del Gran Premio de Japón desde la primera curva que se ponía en cabeza y aguantó la presión de Viñales y Rabat al final de la carrera y los 2 españoles completaron el podio. Tito conservador aumenta la distancia en puntos sobre Mika Kallio que solo pudo ser quinto.
Rabat salía primero en una carrera programada a 23 vueltas al circuito de Motegi seguido por Luthi y Zarco. Se apagaba el semáforo y se daba comienzo al gran premio.
Salida sin incidentes aunque Rabat sale fatal y al final de la primera vuelta había perdido cuatro posiciones era quinto. Por delante Kallio intentaba progresar pero Zarco tapaba muy bien los huecos y en primera posición Luthi se iba escapando poco a poco.
Por detrás en el pelotón se dava la primera baja de la carrera, Russo se iba al suelo y un par de vueltas más tarde Lowes hacia lo mismo.
En cabeza, Viñales superaba a Kallio que también era superado por Rabat tras irse un poco largo en una curva y Luthi iba marcando vuelta rápida tras vuelta rápida. Aunque por detrás de el también Rabat, Kallio y Viñales empezaban a rodar en los mismos tiempos que el.
Seguíamos con caídas esta vez de Sandro Cortese y Mattia Pasini aunque sin consecuencias ya que conseguían volver a pista con la ayuda de los comisarios. Finalmente se retirarían.
En la vuelta 9 Viñales y Rabat conseguían pasar a Zarco que era un tapón y poco a poco se alejaban de el aunque Luthi seguía haciendo buenos tiempos y a falta de 10 vueltas el que empezaba a rodar más rápido era Tito Rabat recortándole mucho tiempo a Maverick y esto hacía que la diferencia con Luthi bajara poco a poco.
Tras dos vueltas Luthi parecía que iba desinflándose, los españoles le estaban dando caza y en otro punto del circuito Schrotter se caía al suelo y acto seguido Axel Pons también probaba la puzolana del circuito de Motegi.
Tito se mostraba más conservador y se quedaba un poco más atrás considerando que Kallio es quinto y le iba a meter más puntos en el campeonato pero Viñales seguía recortando a Luthi que seguía perdiendo décima a décima con el español.
En la penúltima vuelta Aegerter se iba al suelo en la curva antes de entrar en la recta de atrás aunque podía continuar.
Pese a la presión de Maverick, Thomas Luthi se lleva la victoria en Moto 2 en el Gran Premio de Japón, tras liderar todas las vueltas y completó el podio Tito Rabat. Mika Kallio finalmente fue quinto.
Resultados:
| Pos. | Nº | Rider | Team | Motorbike | Gap | Diff | |
| 1 | 12 | Thomas LUTHI | SWI | Interwetten Paddock Moto2 | Suter | ||
| 2 | 40 | Maverick VIÑALES | SPA | Paginas Amarillas HP 40 | Kalex | + 1,209 | + 1,209 |
| 3 | 53 | Esteve RABAT | SPA | Marc VDS Racing Team | Kalex | + 3,613 | + 2,404 |
| 4 | 5 | Johann ZARCO | FRA | AirAsia Caterham | Caterham Suter | + 7,797 | + 4,184 |
| 5 | 36 | Mika KALLIO | FIN | Marc VDS Racing Team | Kalex | + 8,472 | + 0,675 |
| 6 | 60 | Julian SIMON | SPA | Italtrans Racing Team | Kalex | + 8,881 | + 0,409 |
| 7 | 21 | Franco MORBIDELLI | ITA | Italtrans Racing Team | Kalex | + 11,203 | + 2,322 |
| 8 | 55 | Hafizh SYAHRIN | MAL | Petronas Raceline Malaysia | Kalex | + 17,503 | + 6,300 |
| 9 | 88 | Ricard CARDUS | SPA | Tech 3 | Tech 3 | + 18,424 | + 0,921 |
| 10 | 19 | Xavier SIMEON | BEL | Federal Oil Gresini Moto2 | Suter | + 21,192 | + 2,768 |
| 11 | 81 | Jordi TORRES | SPA | Mapfre Aspar Team Moto2 | Suter | + 22,646 | + 1,454 |
| 12 | 94 | Jonas FOLGER | GER | AGR Team | Kalex | + 23,303 | + 0,657 |
| 13 | 30 | Takaaki NAKAGAMI | JPN | IDEMITSU Honda Team Asia | Kalex | + 26,077 | + 2,774 |
| 14 | 8 | Gino REA | GBR | AGT REA Racing | Suter | + 26,708 | + 0,631 |
| 15 | 39 | Luis SALOM | SPA | Paginas Amarillas HP 40 | Kalex | + 28,921 | + 2,213 |
| 16 | 96 | Louis ROSSI | FRA | SAG Team | Kalex | + 29,321 | + 0,400 |
| 17 | 7 | Lorenzo BALDASSARRI | ITA | Gresini Moto2 | Suter | + 31,192 | + 1,871 |
| 18 | 77 | Dominique AEGERTER | SWI | Technomag carXpert | Suter | + 33,956 | + 2,764 |
| 19 | 14 | Ratthapark WILAIROT | THA | AirAsia Caterham | Caterham Suter | + 41,606 | + 7,650 |
| 20 | 20 | Florian MARINO | FRA | NGM Forward Racing | Kalex | + 42,031 | + 0,425 |
| 21 | 4 | Randy KRUMMENACHER | SWI | Octo IodaRacing Team | Suter | + 42,133 | + 0,102 |
| 22 | 18 | Nicolas TEROL | SPA | Mapfre Aspar Team Moto2 | Suter | + 44,568 | + 2,435 |
| 23 | 71 | Tomoyoshi KOYAMA | JPN | Teluru Team JiR Webike | NTS | + 45,571 | + 1,003 |
| 24 | 25 | Azlan SHAH | MAL | IDEMITSU Honda Team Asia | Kalex | + 51,944 | + 6,373 |
| 25 | 10 | Thitipong WAROKORN | THA | APH PTT The Pizza SAG | Kalex | + 51,944 | + 0,000 |
| 26 | 72 | Yuki TAKAHASHI | JPN | Moriwaki Racing | Moriwaki | + 52,398 | + 0,454 |
| 27 | 97 | Roman RAMOS | SPA | QMMF Racing Team | Speed Up | + 53,160 | + 0,762 |
| 28 | 70 | Robin MULHAUSER | SWI | Technomag carXpert | Suter | + 58,088 | + 4,928 |
| 29 | 23 | Marcel SCHROTTER | GER | Tech 3 | Tech 3 | + 1:06,689 | + 8,601 |
| 30 | 65 | Chalermpol POLAMAI | THA | Singha Eneos Yamaha Tech | Tech 3 | + 1:22,685 | + 15,996 |
| DNF | 49 | Axel PONS | SPA | AGR Team | Kalex | + 6 Laps | – |
| DNF | 95 | Anthony WEST | AUS | QMMF Racing Team | Speed Up | + 10 Laps | – |
| DNF | 54 | Mattia PASINI | ITA | NGM Forward Racing | Kalex | + 12 Laps | – |
| DNF | 11 | Sandro CORTESE | GER | Dynavolt Intact GP | Kalex | + 16 Laps | – |
| DNF | 22 | Sam LOWES | GBR | Speed Up | Speed Up | + 20 Laps | – |
| DNF | 84 | Riccardo RUSSO | ITA | Tasca Racing Moto2 | Suter | + 23 Laps | – |